Panagrolaimus kolymaensis: Nematoda Siberia yang Bertahan Selama 47.000 Tahun dalam Kriptobiosis. Tulisan ini mengungkap penemuan mengejutkan tentang nematoda permafrost yang telah bertahan dalam keadaan kriptobiosis selama 47.000 Tahun.
Cekricek.id - Dalam sebuah penemuan yang mengejutkan dunia sains, Anastasia Shatilovich dari Institute of Physicochemical and Biological Problems in Soil Science RAS di Rusia berhasil menghidupkan kembali dua nematoda cacing gelang purba yang telah membeku dari sebuah lubang fosil di deposit lumpur di permafrost Siberia.
Dilansir Sciencedaily, analisis radiokarbon dari materi tanaman di lubang tersebut menunjukkan bahwa deposit beku ini, yang berada 40 meter di bawah permukaan, belum mencair sejak akhir Pleistosen, antara 45.839 dan 47.769 tahun yang lalu.
Pada saat yang sama, kelompok penelitian Teymuras Kurzchalia di MPI-CBG sedang meneliti bagaimana tahap larva dari nematoda Caenorhabditis elegans bertahan dalam kondisi ekstrem. Ketika tim tersebut mendengar tentang nematoda permafrost, mereka segera mengajukan kerjasama dengan Anastasia Shatilovich.
Vamshidhar Gade, yang saat itu adalah mahasiswa doktoral di kelompok penelitian Teymuras Kurzchalia, mulai bekerja dengan nematoda permafrost. "Jalur molekuler dan metabolik yang digunakan organisme kriptobiotik ini dan berapa lama mereka dapat menangguhkan kehidupan belum sepenuhnya dipahami," kata Vamshidhar, yang kini bekerja di ETH di Zurich, Swiss.
Peneliti di Dresden melakukan perakitan genom berkualitas tinggi dari salah satu nematoda permafrost tersebut.
Meskipun memiliki sekuens barcoding DNA dan gambar mikroskopik, sulit untuk menentukan apakah cacing permafrost tersebut adalah spesies baru atau tidak.
Philipp Schiffer, pemimpin kelompok penelitian di Institute of Zoology, bergabung dengan peneliti Dresden untuk menentukan spesies dan menganalisis genomnya bersama timnya.
Dengan analisis filogenomik, dia dan timnya mampu mendefinisikan cacing bulat tersebut sebagai spesies baru, dan tim memutuskan untuk menamainya "Panagrolaimus kolymaensis."
Dengan membandingkan genom Panagrolaimus kolymaensis dengan nematoda model Caenorhabditis elegans, peneliti di Cologne mengidentifikasi gen yang dimiliki kedua spesies dan yang terlibat dalam kriptobiosis.
Tim penelitian selanjutnya mengevaluasi kemampuan Panagrolaimus kolymaensis untuk bertahan dan menemukan bahwa paparan dehidrasi ringan sebelum pembekuan membantu cacing mempersiapkan kriptobiosis dan meningkatkan kelangsungan hidup pada suhu -80 derajat Celsius.
Menurut Vamshidhar Gade dan Temo Kurzhchalia, "Temuan eksperimental kami juga menunjukkan bahwa Caenorhabditis elegans dapat tetap layak hidup untuk periode yang lebih lama dalam keadaan tergantung daripada yang sebelumnya didokumentasikan. Secara keseluruhan, penelitian kami menunjukkan bahwa nematoda telah mengembangkan mekanisme yang memungkinkan mereka untuk mempertahankan kehidupan selama periode waktu geologis."
Philipp Schiffer, salah satu penulis yang mengawasi studi tersebut, menyimpulkan, "Temuan kami sangat penting untuk memahami proses evolusi karena waktu generasi dapat berkisar dari hari hingga milenium dan karena kelangsungan hidup jangka panjang individu spesies dapat menghasilkan munculnya kembali garis keturunan yang seharusnya sudah punah."
